将门怪异的核心，在那颗被斩下的头颅的故事。这事在记述叛乱的同时代之作《将门记》^[1]里并不见，而是晚得多、到南北朝时期的《太平记》^[2]等才讲起的传说。据说，被示众在京城七条河原的将门首级，几个月都不腐，睁着眼咬牙，夜夜叫喊“我的身躯在哪里，接上来再战一场”。有个叫藤六左近的人对它咏了一首狂歌：“将门啊，是从太阳穴上被斩的，全凭俵藤太的算计”，首级便咯咯笑起来，那一夜放出白光，飞向东国去了。

飞走的头落下的地方，相传就是如今东京大手町的将门冢（首冢）^[3]。这座冢直到近代，仍因“一试图迁移或拆除就出灾祸”而被人畏惧。关东大地震后大藏省在冢址上盖了临时办公楼，相关人员接连去世；战后想平整地面的推土机翻车、司机身亡——这些都被当作作祟来讲。不过大藏省那些人的死，是动工好几年之后的事，很难当成因果接上，这些大体属于近代的都市传说。冢上供着青蛙摆件，是取首级向东“归来”（かえる，与“青蛙”同音）的谐音。

将门又是“从降祟的怨灵转成守护之神”的典型。延庆二年（1309），疫病被归为将门作祟时，时宗的真教上人镇住了那股亡灵，把它供进神田明神^[4]的相殿。元和二年（1616）德川秀忠把神社迁到今址后，神田明神成了江户的总镇守，将门命作为除灾、武运、生意兴隆之神广受崇敬。明治时他曾因“逆臣”之名一度被请出本殿祭神之列，到昭和五十九年（1984）又复为祭神。他终焉之地坂东的国王神社，相传是三女如藏尼在父亲三十三周年忌时刻了座像而创建的。

将门与菅原道真、崇德天皇并称“日本三大怨灵”。不过把这三人凑在一起的叫法，正如怨灵研究的山田雄司等人所指出的^[5]，是经由江户时代的读本和歌舞伎传开的近世框架。另外，那个操使巨大骸骨的泷夜叉姬的故事，是后世以将门之女为主角的歌舞伎、读本的衍生，要和将门本人的传承区分开来。